关掉Linux系统中的Tomcat服务器通常可以通过以下步骤来完成:

1. 打开终端窗口或SSH连接到服务器上。
2. 使用以下命令来检查Tomcat是否正在运行:
```shell
ps -ef | grep tomcat
```
3. 根据查到的Tomcat进程ID(PID),使用以下命令来杀掉Tomcat进程:
```shell
kill -9
```
4. 检查Tomcat进程是否已经停止运行:
```shell
ps -ef | grep tomcat
```
5. 如果Tomcat进程已经停止,表示Tomcat服务器已成功关闭。
注意:以上步骤假设您对Linux系统和命令行操作有一定了解,操作时要小心谨慎避免影响系统运行。